这一年，魏格纳进了柏林因斯布鲁克大学，学习天文和气象学。毕业后，他又跟随著名气象学家柯彭教授学习高空气象学，并于1905年获得了气象学博士学位。1906年，魏格纳以官方气象学家的身份，应邀参加了丹麦一支著名的探险队，去世界第一大岛格陵兰东北部探险。这之后，魏格纳度过了两年异常艰辛的探险生活。探险经历中，他获得了大量珍贵的第一手的气象学、地质学资料，这些对他后来的“大陆漂移”学说的提出，起到了重要作用。
1910年的一天，魏格纳因风寒病躺在床上休息。不过他的大脑却闲不住，他看着对面墙上的世界地图不停地思索着。突然，他惊奇地发现，大西洋两岸，南北美洲的东海岸和欧洲、非洲的西海岸，轮廓非常的吻合，这边大陆突出部分和那边大陆的凹进部分形状几乎完全一样。这是怎么回事呢？这些大陆板块之间有什么渊源吗？难道他们以前是一体的吗？魏格纳的大脑兴奋起来，他再也躺不住了，便起身去查阅地质学、地理学资料。这之后，魏格纳坚持不懈地研究着这个问题。1915年，他写出《海陆的起源》，系统地提出了“大陆漂移”学说。